根據《國務院關于印發個人所得稅專項附加扣除暫行辦法的通知》（國發〔2018〕41號）第十七條規定，納稅人在主要工作城市沒有自有住房而發生的住房租金支出，直轄市、省會（首府）城市、計劃單列市以及國務院確定的其他城市，扣除標準為每月1500元。

故在深圳市（計劃單列市）的住房租金專項附加扣除標準為每月1500元。